ضمت إضافة المخطوطات الأحسائية المختلفة «17» مخطوطة للشيخ الأحسائي، مع وجود «9» نسخ مخطوطة مكررة لبعض الكتب [18] .

معهد الشهيد مطهري العالي «طهران» :

يضم المعهد بين جنباته كمية كبيرة من المخطوطات الهامة وقد كان حظ الكتب الأحسائية ليس بالشيء اليسير، فقد حوت المكتبة للشيخ الأحسائي وحده «28» مخطوطة لكتب مختلفة، إضافة إلى «28» [19] مخطوطة مكررة لنفس الكتب السابقة يصل عدد بعض المخطوطات لكتاب واحد إلى «9» نسخ، وهذا يكشف الأهمية التي تحضا بها هذه المكتبة، ومما لا يبعد أنها تحوي مخطوطات أحسائية أخرى.

مكتبة العتبة الرضوية المقدسة:

أُنشئت هذه المكتبة بأمر من الشاه عباس الصفوي، وباهتمام الشيخ بهاء الدين العاملي «الشيخ البهائي» ، وذلك عن طريق استعادة الكتب المنهوبة من مكتبة گوهرشاد، والكتب الموقوفة الأخرى. ومنها دمج مكتبة الشيخ علي المنشار صهر الشيخ البهائي.

وقد اتسعت هذه المكتبة بمرور الزمان، وهي اليوم ـ خاصة بما تُقدّمه من خدمات ـ من أنفَس مكتبات العالَم، أما مخطوطاتها فهي تزيد على عشرين ألف مخطوطة، هذا ناهيك على عشرات المكاتبات الخاصة التي تهدى للمكتبة، وهي تحوي الكثير من نفائس المخطوطات.

وقد ضمت المكتبة عشرات المخطوطات الأحسائية لعدد من أعلامها الكبار وهي:

-الشيخ أحمد بن زين الدين الأحسائي «ت 1241هـ» : «31» مخطوطة، كما يوجد لبعض هذه المخطوطات نسخ مكررة بأقلام نسَّاخ آخرين يبلغ عددها «12» نسخه [20] .

-كما ضمت مخطوطة واحدة للشيخ أحمد بن عبد الله السبعي الأحسائي «ت 860هـ» [21] .

-ديوان علي بن المقرب العيوني كانت في المكتبة الفاضلية وبعد خرابها انتقلت إلى مكتبة الرضوية [22] .

-الشيخ محمد بن علي بن أبي جمهور الأحسائي: «9» من مؤلفاته المخطوطه [23] .

-الشيخ علي نقي بن الشيخ أحمد بن زين الدين الأحسائي: «10» من نسخ مخطوطاته [24] .