مكتبة أسسها الحاج إسماعيل هدايتي تاجر ووجيه يهوى الكتب ويسعى للحصول عليها، فكون مكتبة في بيته تحوي عشرة ألاف مطبوع، وثلاثة ألاف مخطوط، وقد قام السيد أحمد الحسيني بفهرست ثلاثمائة نسخة منها فقط، فورد بينها من المخطوطات الأحسائية مايلي [52] :

-الشيخ أحمد بن زين الأحسائي: «6» مخطوطات.

-الشيخ محمد بن أبي جمهور الأحسائي: مخطوطة واحدة.

وبالطبع إذا كان من بين 10% من مقتنيات المكتبة سبع مخطوطات أحسائية، فهناك المزيد في 90% الباقية.

مركز أحياء التراث الإسلامي «قم المقدسة» :

من المراكز الهامة في مدينة قم المقدسة وقد استطاع أن يحوي بين مخطوطاته «7» مخطوطات أحسائية [53] .

مكتبة مدرسة الإمام الصادق «مدينة بروجرد» :

مدرسة الإمام الصادق «نور بخش» من المدارس العلمية القديمة بمدينة بروجرد، أسست متكبتها سنة 1368هـ، بأمر المرجع الديني السيد آقا حسين البروجردي، وفيها نحو أربعمائة وخمسين نسخة مخطوطة، قام السيد أحمد الحسيني بفهرسة مائتين وخمسين نسخه، فكان بينها من المخطوطات الأحسائية ما يلي [55] :

-الشيخ أحمد بن زين الدين الأحسائي: مخطوطة واحدة.

-الشيخ علي نقي بن الشيخ أحمد بن زين الدين الأحسائي: مخطوطة واحدة.

المكتبات التي تحوي مخطوطتين:

مكتبة دهخدا بطهران، مدرسة إمام العصر بشيراز، عتبة أحمد بن موسى بشيراز، العتبة المقدسة «قم"نقيبتي"» ، معهد قريب العالي بطهران، مكتبة فارس الوطنية بشيراز، خانقاه نعمت اللهي بطهران [56] .

المكتبات التي تحوي مخطوطة واحدة:

نستطيع القول أن المكتبة التي يوجد فيها مخطوط واحد من مؤلفات الشيخ الأحسائي فهي كثيرة ويمكن ذكرها كما يلي: