إلى جانب ذلك، تهتم الكلية بقضايا الوحدة الإسلامية على قاعدة المشروع الذي ذكرناه في عدة من أبحاثنا، وهو إعادة توحيد"السنة النبوية"ما ورد من طريق أئمة أهل البيت (ع) أو ما ورد منها من طريق الصحابة. وهذه"السنة"التي تنقسم الآن إلى قسمين، يأخذ الشيعة بجانب منها هو سُنة أهل البيت، ويأخذ السنة بجانب منها وهو سنة الصحابة ( أهل السنة يأخذون بما صح عن آل البيت، الراصد) ، وقلما يلتقيان. وقد وضعنا الأساس النظري الصحيح إن شاء الله لتوفير هذه السنة. هذا فيما يتعلق بالجانب الإسلامي.

أما فيما يتعلق بالجانب الديني العام، فتعنى هذه الجامعة بعلم الأديان المقارن وبالحوار الإسلامي ـ المسيحي: الحوار الإسلامي المسيحي على مستوى لبنان والعالم العربي في الأقل. وهناك طموح لأن تكون هناك مشاركة لهذه الجامعة في الحوار الإسلامي ـ المسيحي على مستوى العالم لأننا نعتبر أن هذا الحوار الجاد والبناء ضرورة من ضرورات المرحلة الحضارية العالمية.

بالنسبة إلى لبنان، هو ضرورة حيوية يومية، والعالم الديني المسلم يجب أن يكون ملمًا بأصول هذا الحوار وبقواعده، هذا إلى جانب علم الأديان المقارن الذي لا بد أن يلم به العالم المسلم.

ومن مقاصد هذه الكلية في"الجامعة الإسلامية"تحديث علم الكلام الإسلامي الذي مضى عليه قرابة أو أكثر من ألف عام وهو لا يزال يدور حول قضايا ومواضيع لم يعد لها أية علاقة بالحياة اليومية والعامة للإنسان في عصرنا، ولم يعد لها أي علاقة بالمشكلات الحضارية والحياتية التي تواجه هذا الإنسان، ولم يعد لها أية علاقة بالشبهات والأفكار التي أثارها تقدم العلم وتطور فلسفة العلم في عصرنا.