كما اتهم جعجع باغتيال عدد من قادة الموارنة، منهم داني شمعون رئيس حزب الوطنيين الأحرار، وطوني فرنجية ابن الرئيس السابق وعائلته، وكلهم ينتمون للطائفة المارونية.

لقد دفع الخلاف الكبير الذي برز في صفوف الموارنة خلال الحرب الأهلية الأخيرة عددًا من المراقبين إلى اعتبار أن تلك الحرب كانت بالأساس حربًا مارونية، تهدف إلى فرض القوة وتقاسم النفوذ، وتمثيل الطائفة، لكن ذلك لا يلغي أن الحرب ايضًا كانت قرارًا خارجيًا لدول تبحث في لبنان عن موطئ قدم، وخاصة إيران وسوريا.

الموارنة في الأزمة السياسية الحالية

كما أن الصف الماروني لم يكن خلال الحرب الأهلية موحّدًا، فهو اليوم أيضًا ليس موحّدًا، فما زال الصف الماروني منقسما انقساما حادّا إزاء انتخاب رئيس للجمهورية الذي ما زال مقعده شاغرا منذ 23/11/2007 ، ويبدو اليوم في لبنان تكتلان أساسيان يتنازعان السلطة وبينهما خلافات عميقة:

الأول: يعرف بـ"تحالف 14 آذار"ويتكون بشكل أساسي من القوى المعارضة لسوريا المتهمة باغتيال رئيس الوزراء السابق رفيق الحريري، وأهم مكونات هذا التحالف تيار المستقبل الذي يرأسه سعد رفيق الحريري، والمحسوب على السنة، والتيار الدرزي برئاسة وليد جنبلاط، إضافة إلى تيارين مارونيين هاميّن، أولهما حزب الكتائب برئاسة أمين الجميل، والآخر تيار القوات اللبنانية برئاسة سمير جعجع.

الثاني: يعرف"بتحالف 8 آذار"ويتشكل أساسًا من القوى الموالية لسوريا، وعلى رأسها حزب الله وحركة أمل، وهما حزبان شيعيان، يدين الأول بالولاء لإيران، والآخر لسوريا. وإضافة إلى حزب الله وأمل، يضم التحالف اثنين من رموز الموارنة هما ميشيل عون وسليمان فرنجية.

أبرز شخصياتهم الدينية والسياسية حاليا:

1-البطريرك مار نصر الله صفير: