والتحكيم العلمي، وغير ذلك من أمور أكاديمية، ويُختار أعضاء مجلس المركز وَفق ضوابط ومعايير محددة.
ويتكون مجلس المركز من مدير المركز رئيسًا، ووكيله أمينًا، وممن يتمُّ
اختيارهم من أساتذة وعلماء عاملين في المركز أو من غير المركز.
ويتفرع عن مجلس المركز عدد من اللجان العلمية والعملية حسب الحاجة.
-الهيئة الاستشارية:
ويتمثَّل دورها في مساعدة مجلس المركز في حدود ما يطلب من أعضاء الهيئة في الأمور الاستشارية الأكاديمية، ويختار أعضاؤها وَفْق الضوابط التالية:
1 -أن يكونوا من المتخصصين.
2 -أن يتصفوا بالموضوعية العلمية.
3 -أن يكونوا من أصحاب الخبرة العلمية والعملية في مجال عمل المركز.
-المتدربون:
وهم مجموعة من الباحثين الجادين الذين تتوفر فيهم الكفاءة العلمية
(درجة البكالوريوس على الأقل) ممن لهم اهتمام بالاستشراق وتخصص في مجال العلوم الإسلامية والحضارية، وتكون الأولوية لمن لديهم لغة أجنبية أو أكثر.
-الموظفون الإداريون والباحثون:
-يُعين للمركز مدير متفرغ بدرجة أستاذ، أو أستاذ مشارك على الأقل، ويعين له وكيل.
-يُعين في المركز موظفون إداريون لتسيير أعماله.
-يُعين في المركز باحثون لمساعدة العلماء المتخصصين في المجالات العلمية المتعددة.