وطريقة الوحدات يمكن استخدامها عن طريق المنهج المحوري، فالتنظيم المحوري يمكن أن يقدم في صورة واحدة أو محاور أساسية، فمثلا يمكن أن يقوم محور حول"الماء ووظيفته في الحياة"ويمكن دراسة هذا المحور من خلال القرآن، والسنة، والفقه، والطبيعة، والكيمياء، والأحياء، والتاريخ والجغرافيا، والبيئة المحلية, كما يمكن دراسة موضوع مثل"النظام الاقتصادي"من خلال القرآن والسنة والفقه، والتاريخ والجغرافيا، والمعلومات السكانية، والتربية.. وهكذا يمكن دراسة الهواء، والبيئة، ونظام الأسرة، والصلاة، والزكاة، والزراعة، والصناعة، والعلاقات الدولية.. إلخ.
وهكذا فإن أسلوب الوحدات يقوم على أساس ترابط المعرفة الإنسانية والخبرة الإنسانية، وعلى أساس التكامل بين المدرسة والحياة، والإيجابية والفاعلية بين الطلاب والمعلمين وبقية عناصر المنهج؛ وعلى أساس المشاركة والتعاون والعمل الجماعي.
ويعتمد تنظيم الوحدات أيضا على أسلوب حل المشكلات والمناقشة, وفن إدارة المعلومات المتكاملة للوصول إلى القدرة على الابتكار, واستشراف آفاق المستقبل والاستعداد له، من أجل القدرة على التعامل مع معطياته.
وهكذا يتضح أن التنظيم المحوري للمنهج, وأسلوب الوحدات يتسقان مع طبيعة التصور الإسلامي للكون والإنسان والحياة.