قسم فيض الله أفندي مهم جدًا من حيث المخطوطات العربية، بينما تتجلى أهمية قسم علي أميري في المخطوطات التركية. وقد أعدت البطاقات لكل من القسمين. فقسم علي أميري يضم المخطوطات العربية والفارسية والتركية. وتنقسم المخطوطات التركية إلى ثلاثة أقسام حسب مواضيعها.