... لقد كان الاسم السابق لهذا المتحف الأوقاف الإسلامية. ويحتوي هذا المتحف على مصاحف ثمينة ومخطوطات ذات قيمة فنية عالية، نقل بعضها من مختلف المكتبات. ومعظم هذه المخطوطات معروضة في قاعات هذا المتحف. وعدد المخطوطات الموجودة هو 2251 مجلد. ولم يتم لحد الآن عمل بطاقات لهذه المخطوطات بالشكل المنتظم المطلوب. والمخطوطات المحفوظة في هذا المتحف قديمة وبديعة بحيث تلقي ضوءًا على تاريخ الخط.
مكتبة متحف الأركيولوجي
... وكان يطلق على هذا المتحف سابقًا المتحف الهمايوني، أي السلطاني. وقد تأسست مكتبة هذا المتحف بجمع عدة مجموعات واقتناء مجموعات أخرى من قبل مؤسس المتحف الأستاذ عثمان حمدي بك. وتحتوي المكتبة على 1689 مجلد من المخطوطات. وقد نظمت بطاقات المخطوطات بشكل علمي.
... بالإضافة إلى هذا، يضم المتحف العسكري 200 مجلد، ومتحف البحرية 123 مجلد، ومتحف ديوان أدبياتي 194 مجلد، ومتحف الأوقاف لفن الخط 200 مجلد، ومتحف سادبرك خانم 200 مجلد من المخطوطات. والمخطوطات المحفوظة في المتحف العسكري مهمة كلها، وتتعلق بمواضيع الحساب والهندسة والفلك والعسكر والجغرافيا. وأما المخطوطات المحفوظة في متحف البحرية، فهي تتعلق بمواضيع الخرائط والجغرافيا وهي مهمة أيضًا. وهذه المخطوطات ومخطوطات متحف سادبرك خانم ومتحف ديوان أدبياتي لم تصنف تصنيفًا علميًا.
مكتبة جامعة إستانبول
... تأسست هذه المكتبة عام 1925 م. وقد تكونت هذه المكتبة من مخطوطات السلطان عبد الحميد الثاني الواردة من قصر يلدز ومجموعات خالص أفندي وصاحب موللا ورضا باشا. وتحتوي المكتبة اليوم على 18000 مجلد، منها 9941 مجلد باللغة التركية، و 6963 مجلد باللغة العربية، و 1615 مجلد باللغة الفارسية. كما تضم المكتبة عددًا قليلًا من المخطوطات المكتوبة باللغة الأرمنية والروسية والألمانية والفرنسية والإيطالية. كما أن المجموعة التي أهداها إلى هذه المكتبة ابن الأمين محمود كمال أينال تضم حوالي 1000 مجلد. ونستطيع أن نقول ـ ويا للأسف الشديد! ـ إن هذه المكتبة التابعة لمؤسسة علمية مثل الجامعة، لم تنظم بطاقاتها بعد على الطريقة العلمية الصحيحة، مع العلم أن المكتبة تحتوي على مخطوطات ثمينة جدًا، وأنها تضم أيضًا متحفًا غنيًا يحتوي على مخطوطات قديمة جدًا وذات مستوى فني رفيع.
... وهناك بعض المؤسسات التابعة لجامعة إستانبول مثل معهد تاريخ الطب في جراح باشا وهو يضم حوالي 600 مجلد، ومعهد تاريخ الطب في جابا وهو يضم حوالي 200 مجلد. (ومعظم هذه المخطوطات يتعلق بعلوم الطب) ، ومعهد الأبحاث الإسلامية بكلية الآداب وهو يضم 143 مجلد، ومعهد الأبحاث التركية وهو يضم حوالي 70 مجلدًا، ومكتبة قسم اللغة التركية وآدابها وهي تضم 115 مجلد، ومركز الأبحاث في التاريخ وهو يضم حوالي 30 مجلدًا. ولم تعدَّ لحد الآن بطاقات منظمة لهذه المخطوطات. ويحتوي مركز أبحاث علوم التاريخ والتكنولوجيا التابع لجامعة إستانبول التقنية بعض المخطوطات في مواضيع الرياضيات والفلك.