فشرع القسمان في الكلية في وضع برامج لمرحلة الدكتوراه كل فيما يخصّه فأعد كل قسم برنامجًا متكاملًا بما في ذلك المقررات الدراسية، فكانت خطة الدراسة في المقررات كما يلي:
1)الخطة الدراسية لمقررات قسم فقه السنة ومصادرها في مرحلة الدكتوراه:
م ... اسم المقرر ... عدد وحداته
1 ... دراسات في فقه السنة ... 4
2 ... دراسات في مصادرا لسنة ... 4
3 ... منهج النقد عند المحدثين ... 4
2)الخطة الدراسية لمقررات قسم علوم الحديث في مرحلة الدكتوراه:
م ... اسم المقرر ... عدد وحداته
1 ... الجرح والتعديل ... 4
2 ... منهج النقد عند المحدثين ... 4
3 ... دراسات في مصادر السنة ... 4
وإن هذه الخطة لمرحلة الدّكتوراه لن تكون هي الأخيرة بمشيئة الله تعالى، بل كلما دعت الحاجة إلى النظر والتعديل نظر فيها بما يحقق المصلحة. ولهذا نصّت المادة الخامسة فقرة (11)