المكتبة التي أسسها العلامة المتتبع الشيخ عبد الحسين بن أحمد الأميني «1320 - 1390هـ» صاحب كتاب «الغدير في الكتاب والسنة والأدب» سنة 1373هـ في النجف الأشرف وقد اقتنى لها عشرات الألوف من نوادر المطبوعات ونفائس المخطوطات [67] ، كما كانت تأتيه الكتب على سبيل الإهداء والتبرع، وقد استطاعت أن تجميع كمية كبيرة من المخطوطات تصل إلى 3600 مخطوط، كان حصة الكتب الأحسائية فيها جيدة وهي كما يلي:

-الشيخ أحمد بن زين الدين الأحسائي: «31» مخطوطة [68] .

-الشيخ حسين بن محمد الأحسائي البحراني: يظهر انه من خواص الملك فتح علي شاه ومحل ثقته، له كتاب"تحفة الملك المنصور في شرح الحديث المشهور: وهو حديث الطينة"شرح المؤلف فيه تمام الأحاديث الواردة في هذا الموضوع. كتبه تحفة للملك فتح علي شاه القاجاري وذكر سببه أن السلطان فتح علي شاه سافر عام 1204هـ ولعله سنة 1234هـ إلى بلاد"أذربيجان"والتقى بعلمائها في زنجان، ومنهم من يدعى السيد محمد، فسأل السلطان عن حديث"الطينة"، فأنكر السيد محمد صدوره، فلما رجع السلطان إلى طهران أمر المؤلف أن يكتب كتابًا في الموضوع، فألف هذا الكتاب، وأطرى على السلطان كثيرًا مبالغًا فيه.

وهي نسخة مجدولة مذهبة،خلال كل سطورها جداول ذهبية، بخط نسخ جيد كتبها الخطاط أحمد بن محمد مهدي الأصفهاني، فرغ منها سنة 1234هـ، والظاهر أن تاريخ فراغ المؤلف 12 ذي الحجة عام 1234هـ، وتاريخ الكتابة أيضًا [69] .

مكتبة مدرسة آية الله البروجردي «النجف الأشرف» :

أسسها السيد حسين البروجردي ـ المرجع الديني الشهير ـ عام 1373هـ، وفيها ما يزيد على خمسة آلاف مطبوع، ومئات المخطوطات، ومن مخطوطاتها الأحسائية:

يوجد في هذه المكتبة مخطوطة واحدة للشيخ الأحسائي [70] .

مكتبة الحكيم العامة «النجف الأشرف» :