2-مجلس شؤون الطائفة: وهو الجهة المسؤولة عن متابعة شؤونها ورعايتها في المجالات الثقافية والاجتماعية والتربوية والمالية ومراجعة الجهات الحكومية والصحافة والنشر، ويشرف على عدة لجان0

3-المجلس الروحاني: ويضم رجال الدين ومهمته إدارة الشؤون الدينية والطقسية للطائفة ,مع ايجاد صيغة للتعاون والتشاور بين المجالس الثلاثة ,ولا يزال هذا النظام معمولا به في العراق.

وبعد حرب الخليج الثانية , هاجر المندائيون خارج العراق بأعداد كبيرة,وانتشروا في بقاع العالم وخاصة في أوربا واستراليا وأمريكا.وبالرغم من قصر مدة تواجدهم في بلاد المهجر وقلة تجربتهم في مجالات التنظيم الاجتماعي خارج الوطن إلا انهم ابدوا نشاطا ملحوظا وسريعا في تكوين جمعياتهم حيث غطت هذه الجمعيات معظم الدول التي تواجدوا فيها واصدروا مجموعة من المجلات الناطقة باسمهم.

ومن هذه الهيئات:

1ـ اتحاد الجمعيات المندائية في المهجر، ومقره كندا. وهو منظمة ثقافية اجتماعية تضم في عضويتها كافة الجمعيات والتجمعات المندائية في دول المهجر.

تم إقرار النظام الداخلي في آب/ أغسطس 2003 في السويد، ويسعى الاتحاد إلى النهوض بالطائفة والتواصل معهم في العراق وإيران، ونشر تراثهم،"وإثبات المركز القانوني"لها أينما وجدت. ويرأسه حاليا أكرم عرار .

2ـ التجمع الوطني الديمقراطي المندائي في العراق، حركة سياسية ظهرت بعد احتلال العراق، طالب بمقعد في مجلس الحكم العراقي المنحل الذي كان مكونًا من 25 عضوًا، كما طالب بأن يكون الصابئة ممثلين في لجنة صياغة الدستور، وفي الجمعية الوطنية (البرلمان) التي غابوا عنها لقلة عددهم، وأصواتهم في الانتخابات التي جرت في يناير 2005.

3ـ الجمعية الفيدرالية المندائية في هولندا، وتقيم العديد من الأنشطة الثقافية والاجتماعية لأبناء الطائفة في هولندا، وتصدر مجلة"الصابئي المندائي". لكنها تعاني خلافات داخلية كثيرة.