وفي جامع الجيوشي كما يوضح أبو العمايم طمست أعمال البياض والتجديد التي تمت بالمسجد وزخارفه التي كانت موجودة سابقا وكذلك جامع اللؤلؤة الذي تغيرت معالمه.

ويشير حجاجي إبراهيم أستاذ الآثار الإسلامية إلى أنه عندما قام البهرة بترميم جامع الحاكم بأمر الله أزالوا كل الإضافات التي طرأت عليه بعد العصر الفاطمي والتي أضافها السنة وتعتبر أثرية. ويضف حجاجي في جامع الجيوشي أيضا قام البهرة بطلائه باللون الأسود ثم الأبيض دون مراعاة لشكله الأصلي.

الفيض الحاكم:

جدير الذكر أن طائفة البهرة في سبيل تكريس وجودها في مصر وتحديدًا بين أكبر أثر تنتمي إليه وهو جامع الحاكم بأمر الله طلبت من المجلس الأعلى للآثار الموافقة علي إنشاء مبنى لهم بالقرب من المسجد يسمى"دار الفيض الحاكم"ليكون مقرًا لهم بدلا من تشتتهم وقد شهدت مناقشات ساخنة حول هذا الموضوع فبينما أيده البعض اعترض عليه البعض الآخر انطلاقا من تأثير المبنى على بانوراما المنطقة الأثرية وكذلك حالة الآثار الموجودة بها وانتهت اللجنة إلى الموافقة على إقامة المبنى وفقا للمعايير المحددة للبناء في هذه المنطقة.

اهتمام أشمل:

وبالإضافة إلى البهرة واهتمامهم بالآثار الإسلامية بمصر هناك أيضا مؤسسة أغاخان التابعة للطائفة الإسماعيلية الشيعية التي يتزعمها كريم أغاخان وقد قامت هذه المؤسسة بعدد من المشروعات المتعلقة بالآثار الإسلامية خاصة المرتبطة بها فعلى سبيل المثال ومنذ حوالي عامين قامت بالاتفاق مع محافظ أسوان على تطوير المنطقة المحيطة بضريح أغاخان بالبر الغربي للمحافظة حيث اتفق الجانبان على أن تشمل عملية التطوير إنشاء مجموعة من الأسواق والبازارات السياحية وبعض المراكز الخدمية الحضارية.