وحينما تم تكوين وزارة الشؤون الإسلامية والأوقاف والدعوة والإرشاد ضمت الجمعيات الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم إليها في عام 1414هـ إنفاذًا للتوجيه السامي ذي الرقم 7 / 5 / 10737 المؤرخ في 10 / 7 / 1414هـ.

وقد قامت الوزارة بعدة خطوات لتطوير لائحة الجمعيات من خلال التجربة التي مرت بها ، وكيفية النهوض بها ، وتطويرها ، وصدر من ذلك عدة قرارات منها:

الموافقة على توحيد الجمعيات الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم في ثلاث عشرة جمعية رئيسة حسب توزيع مناطق المملكة، وتكون الجمعية الرئيسة في عاصمة المنطقة، وتتولى الوزارة الإشراف على هذه الجمعيات للأغراض التالية:

1.متابعة نشاط الجمعيات الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم ،ومراكزه الخاصة بالمملكة وتوجيهه بما يضمن ازدهاره وتطويره.

2.الإسهام في تطوير الدعم المالي للجمعيات الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم، والمدارس الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم، عن طريق ما يخصص لذلك في الميزانية السنوية للوزارة، وتشجيع المحسنين على التبرع لها ومعاونتها.