28-ولعل السبب الرئيسى في ذلك الاعتقال ، أن العيسوى ذكر في معرض التحقيق معه ، أنه يطلب أخذ رأى زعماء البلد في إعلان الحرب ، وذكر اسم الأستاذ البنا في معرض أسماء الزعماء الذين يجب أخذ رأيهم . ولكن النيابة آفرجت عنهم بعد ذلك ، وبادرالأستاذ البنا إلى زيارة النقراشى معزيا في ماهر ، وراجيا أن يطلق له حرية العمل . بيد أن النقراشى لم يستجب إلى الرجاء وفرض عليهم أثقل القيود في نشاطهم ، واجتماعاتهم ، ومراقبة دورهم وكان يسمح لهم بعقد اجتماعات عامة ، أو مؤتمرات عامة ، تحت ضغط الظروف . . ولكن سرعان ما يعود إلى سياسة العنت والإرهاق .

وانتهت الحرب سنة1945 ودخلت الجماعة بعد ذلك في دور المحنة الكبرى ، لأنها تزعمت قيادة الحركة الشعبية ، وألهبت المشاعر الوطنية ، للمطالبة بحقوق البلاد التى وعد الإنجليز اثناء الحرب بتحقيقها ، فور انتهاء الحرب وإعلان الهدنة . واجتمعت الجمعية العمومية للإخوان في 8 سبتمبر سنة1945 م ، شوال سنة 1364 هـ ، وأدخلت بعض التعديلات على النظام الأساسى حتى أضحى شاملا لجميع غايتها ووسائلها بصورة واضحة . واقاموا شركات اقتصادية متنوعة ، ودرت عليهم الأرباح ، ومكنت لهم في أوساط العمال . وأصدروا جريدة يومية ، صدر العدد الأول منها يوم 5 مايو سنة 1946 الموافق 3 جمادى الثانى سنة365 1 وأضحى بذلك صوتهم مسموعا في مصر والبلاد العربية . وأنشئوا الكتائب ، وأقاموا أماكن التدريب على الأعمال العسكرية . ونظموا الشعب تنظيما دقيقا في مصر والأقطار العربية . ووزعوا الأعمال على الأعضاء ، وأوثقوا العهود بصورة بيعة لرئيس الشعبة فالمرشد العام شخصيا ، وقرروا السمع والطاعة في المنشط والمكره ، مقرونا بالقسم ، ووضعوا المرشد العام موضع الثقة التامة ، وجعلوا له المنصب مدى حياته ليس له أن يتخلى عنه ، أويعفى منه ، إلا بقرار من الهيئة التأسيسية .