تقدم إذاعة القرآن الكريم برامج تفسير القرآن الكريم التي توضح معانيه وتجلي ما فيه من أحكام وتبين ما فيه من عقائد وعبادات وحكم وأخلاق عبر منهجية المفسرين السلفية المعروفة المعتمدة على تفسير القرآن بالقرآن أو بالسنة أو بفهم الصحابة أو بالقياس الصحيح. وقد سجلت إذاعة القرآن الكريم عددا من البرامج في هذا المجال كان لها صدى طيب عند معظم المستمعين، وتمت إعادة إذاعتها مرات عدة، وستعاد إن شاء الله في الأوقات المناسبة أيضًا ومن أهم هذه البرامج:
تفسير الشيخ / عبد الرحمن بن سعدي (رحمه الله) بصوت الشيخ محمد العرفج .
تفسير أضواء البيان للشيخ / محمد الأمين الشنقيطي (رحمه الله) بصوت الشيخ عبد العزيز المقحم .
مع ابن كثير في تفسيره للشيخ / محمد الراوي ثم أتمه الدكتور / بدر البدر .
تلاوة وتفسير للشيخ / عبد العزيز المسند .
آيات وتفسير للشيخ / عبد القادر شيبة الحمد .
تفسير القرآن للشيخ / المكي الناصري .
7 -تفسير القرآن العظيم للشيخ / محمد متولي الشعراوي .
8 -من لطائف التفسير للشيخ / أحمد فرح عقيلان .
9 -التفسير الميسر للدكتور / محمد بن لطفي الصباغ .