العداء علنيًا للفرعون، وفي الوقت نفسه لم يرد"امنوفس الرابع"إظهار العداء العلني للآلهة المصرية وكهنتها وبالذات كهنة آمون بل بالعكس حاول أن يكسب إلى جانبه بعض الأنصار للدعوة الجديدة.
اخذ الفرعون يعمل على ترسيخ عبادة آلهه بشكل تدريجي عن طريق قيامه بسلسلة من الأعمال فبنى لنفسه قصرًا سماه (مباهج الأفق) أي أفق آتون، وأمر ببناء معبد ل"آتون"في مدينة طيبة. فبدأ الصراع بين الجانبين الفرعون من ناحية وكهان آمون من ناحية أخرى خاصة عندما عرفوا أن الإله الجديد يختلف في شكله وتعاليمه عن الآلهة المصرية الأخرى فقد اهتدى الفرعون إلى رمز جديد لإلهه على شكل قرص يرسل بأشعته إلى الأرض وتنتهي الأشعة بأيدي تقبض على رمز الحياة، إذ قال عنه (انه كائن في شكل شيء) وحرم عمل تماثيل لمعبوده الجديد"آتون"، ونادى باله واحد لا اله غيره وطلب من الناس إتباع الإله الجديد والانصراف عن الآلهة القديمة. بدأ الكهنة يكيدون له ولمعبوده الجديد وهذا ما نلمسه من شكواه المنقوشة على حجر"اقسم بابي المعبود رع هرمخيس آتون أن تصرفات الكهنة التي رأينا منهم في السنة الرابعة من حكمي ورآها قبلي أبي وجدي مؤلمة ومدهشة"ويوضح هذا النص أن لثورته الدينية أسبابا أخرى.
وفي العام السادس من حكمه بدأ يتدرج في تطرفه فغير اسمه من"آمون حتب"أو"منوفيس"ومعناه (آمون الطيب) إلى (اخن آتون) أي (اخناتون) ومعناه (مجد آتون) بهدف محو ذكر آمون من اسمه ولتمجيد معبوده الجديد. أما"نفرتيتي"زوجة"اخناتون"فقد غيرت أسمها ايضًا الى"نفر - نفرو - آتون"أي (جميل هو بهاء آتون) ، كما حملت الأميرات من بنات الملك أسماء تحتوي على أسم الاله الجديد مثل"مريت آتون"و"ماكت آتون"و"عنخ آس ان باآتون". وأمر بإغلاق معابد الآلهة الأخرى في كل أنحاء الإمبراطورية وصودرت مملكاتها وعطلت شعائرها وحجزت خزائن الكهنوت، وخاصة أوقاف الإله آمون واسقط كهنته، حيث أمر بحل هيئة الكهنة. وفي نفس العام أمر ببناء عاصمة جديدة لحكمة غير مدنسة بعبادة الآلهة القديمة وبعيدة عن نفوذ الإله آمون وكهنته فوقع الاختيار على (العمارنة) في مصر الوسطى والتي دعاها ب (اخيتاتون) أي (أفق آتون) أو (مشرق آتون) . حيث قام ببناء معابد ل (آتون) في عاصمته الجديدة. ثم طلب من أتباعه محو كل ذكر ل"آمون"على المخلفات الاثارية وشملت هذه العملية تحطيم وإزالة أثار المعبودات الأخرى وبلغ تطرفهم درجة أن سعى أتباعه داخل المقابر لمحو صور الآلهة القديمة وأسمائها، وحتى كلمة (أم) التي تشبه الآلهة الطيبية (موت) زوجة آمون أمر بالتخلي عن كتابتها بالرسم الهيروغليفي للعقاب (نخبت - نخابة) وأمر أن تكتب بالحروف بعلامتي (م ت) وأزال كلمة الآلهة (بصيغة الجمع) المنقوشة على المسلات والهياكل والمعابد لتناقضها مع عقيدة الوحدانية، كما أقام لإلهه المعابد في العديد من