ولي في الكتاب أسانيد كثيرة بالإجازة، ذكرتها في مقدمة شرح البخاري مما تمس الحاجة إليه، منها:
طريق الأصيلي: أخبرنا بها أبو علي محمد بن احمد بن علي بن عبد العزيز المهدوي إذنًا مشافهة، عن يحيى بن محمد بن سعد، عن جعفر بن علي الهمداني، أنبأنا أبو محمد عبد الله بن عبد الرحمن الديباجي إجازة أنبأنا عبد الله ابن محمد بن محمد بن علي الباهلي حدثنا الحافظ أبو علي الحسين بن محمد الجياني في كتاب"تقييد المهمل"له، أنبأنا أبو شاكر عبد الواحد بن محمد بن موهب ابن الحافظ أبي محمد عبد الله بن إبرهيم الأصيلي أنبأنا أبو زيد محمد بن أحمد المروزي، أنبأنا البخاري.
وطريق ابن عساكر: اخبرنا بها الشيخ أبو إسحاق التنوخي مشافهة عن أبي نصر محمد بن محمد بن محمد بن عبد الله الشيرازي الفارسي إجازة عن جده أبي نصر عن الحافظ أبي القاسم علي بن الحسن بن هبة الله ابن عساكر أنبأنا أبو عبد الله محمد بن الفضل الصاعدي الفراوي أنبأنا أبو سهل محمد بن أحمد الحفصي أنبأنا الفربري
أنبأنا البخاري.
وطريق ابن السكن: بالإسناد الماضي إلى أبي علي الجياني أنبأنا أبو عمر أحمد ابن محمد بن يحيى الحذّاء سماعًا وأبو عمر يوسف بن عبد الله بن عبد البر إجازة قالا: أنبأنا أبو محمد عبد الله بن محمد أسد الجهني أنبأنا أبو علي سعيد بن عثمان بن سعيد بن السكن الحافظ أنبأنا الفربري أنبأنا البخاري.
وهذه الطرق كلها راجعة إلى الفربري. وقد ورد لنا صحيح البخاري من وجهين آخرين عن البخاري:
أحدهما: رواية النسفي: بهذا الإسناد إلى أبي علي الجياني: أنبأنا الحكم بن محمد أنبأنا أبو الفضل ابن أبي عمران الهروي سماعًا لبعضه وإجازة لباقيه أنبأنا أبو صالح خلف ابن محمد بن إسماعيل أنبأنا إبراهيم بن معقل النسفي أنبأنا البخاري.