فقد دخلت العلاقة بين لجان المقاومة الشعبية والسلطة مراحل حرجة، وخاصة عقب رفض لجان المقاومة الشعبية الانصياع لقرارات وقف إطلاق النار الشامل التي أصدرتها قيادة السلطة إبان الانتفاضة، مما دفع أجهزة السلطة إلى زج بعض عناصرها في السجون وفصل أو تهديد بعضهم بالفصل من أعمالهم داخل أجهزة السلطة أو حرمانهم من رواتبهم الوظيفية وتخييرهم بين البقاء في أعمالهم الوظيفية مع ترك العمل المقاوم أو فصلهم منها حال إصرارهم على مواصلة العمل المقاوم ضد الاحتلال.

ورغم النشاط الملحوظ الذي تبديه لجان المقاومة في قطاع غزة إلا أنها لا تتمتع بالقدر ذاته في الضفة الغربية إذ لا تتوفر أية أدلة على امتداد تنظيمي لهذه اللجان هناك مما يجعلها مقتصرة على حدود قطاع غزة فحسب.

المقاومة الفلسطينية الشعبية/

لا يمكن وصف مصطلح"المقاومة الفلسطينية الشعبية"بأكثر مما يحتمل أو يستحق، أو إدراجه كتنظيم فلسطيني شعبي له إسهاماته ضد العدو الصهيوني.

غير أن الحاجة تبدو ماسة لإدراج تعريف مناسب لهذا لمصطلح الذي تكرر كثيرًا في سياق العمل المقاوم ضد الاحتلال ومستوطنيه، وحاز على نسبة معتبرة ورصيد جيد في إطار العمل الكفاحي المتواصل.

ويمكن القول أن المقاومة الفلسطينية الشعبية تمثل سائر العمليات العسكرية التي نفذت ضد قوات الاحتلال وقطعان المستوطنين دون أن يتبناها أو يتحمل مسئوليتها أحد من فصائل المقاومة المعروفة، أو تلك التي نفذها مواطنون فلسطينيون مقاومون بشكل شخصي فردي دون ارتباط تنظيمي بأحد.