الهبطي تعرض للإهانة والضرب والحبس، نفهم ذلك مما يذكره ولده محمد بن عبد الله الهبطي في منظومته في ترجمة والده:

كم سامه بالضرب والتهاون ... والي وقاضي الجور بشفشاون

سجنه القاضي عدو نفسه ... من غير جرم موجب لحبسه

والقاضي المقصود هنا هو القاضي محمد بن أحمد بن الحاج، وهذا القاضي تولى القضاء بشفشاون مدة طويلة، أما الوالي فهو محمد بن علي بن راشد، ويشير العلامة أبو الحسن علي اليوسي في"المحاضرات"إلى ما لاقاه الشيخ عبد الله الهبطي من بعض معاصريه من مضايقات .. وهكذا فتن الشيخ عبد الله الهبطي كما يفتن الدعاة والمصلحون في كل زمان ومكان؛ إلا انه بالرغم من ذلك ظل صامدا صابرا محتسبا، وواصل المضي في رسالته الإصلاحية إلى أن شل في آخر عمره وعجز عن المشي، لكنه لم ينقطع عن عقد حلقات الدرس ولا عن مجالسه العلمية بفضل من الله ..

ترجم للشيخ عبد الله الهبطي كثير من الأفاضل منهم محمد العربي الفاسي في"مرآة المحاسن"، ومحمد المهدي الفاسي في"ممتع الأسماع"، المراكشي السملالي في"الإعلام"، وابن عسكر في"الدوحة"، وابن القاضي في"الدرة"، و"الجذوة"، والحضيكي في"طبقاته"، وسيدي أحمد