ونشأ فيهم). تلك العبارة التي تعلل النسبة إلى تلك القبيلة بالميلاد والنشأة"."
هاجر والد محمد بن عيسى من سوس ونزل عند الفهديين وهم فرع من قبيلة مختار، فتزوج منهم ورزق بصاحبنا الإمام محمد بن عيسى، وقد حضي الطفل مَحمد (فتحا) بعناية خاصة من طرف والده وأخواله، وقد رافقه والده إلى مدينة فاس ليهيئ له الظروف الملائمة للإقامة من أجل تلقي العلم بجامع القرويين.
قال عبد الرحمن الفاسي في"ابتهاج القلوب بخبر الشيخ أبي المحاسن وشيخه المجذوب"عن الشيخ بن عيسى:
نشأ في ظلال العز وارتضع العلا ... فجاء تقي يختال في رتب الشمم
كان الشيخ بن عيسى يلقب بالكبريت الأحمر وببركة أهل السماء والأرض. وقد قال الشيخ سيدي بصري دفين قبة السوق بمكناس (بتصرف) : وقد تربى محمد بن عيسى في بيئة علم وصلاح، وكان رحمه الله منذ ولد متحليا بالكمال والجلال والجمال ولم يظهر عليه عيب خيانة قط لا في الحال ولا في المقال، وكان كريم النفس مهيب المنظر كثير الأدب جميل المعاشرة صاحب محبة وحنانة حلو الكلام ..