منها إلى مراكش. من شيوخه في العلم أبو محمد عبد الله بن علي بن طاهر الحسني، وأبو القاسم الغول الفشتالي، وأبو عيسى السكتاني. كان له تلامذة كثيرون، وهو الذي أجاز العلامة أبي الحسن اليوسي، وإلى جانب شهرته في علم التوقيت والحساب؛ فإنه قد ألف في مواضيع أخرى: من تآليفه كناشة فهرسة العوائد (مخطوط بالخزانة الوطنية 285د) ، ومجموعة أخرى ذكرها محمد المنوني في مقاله عن المكتبة الحمزاوية (مجلة تطوان، عدد 8) ".."

وقد ترجم لمحمد بن سعيد المرغيثي كل من اليوسي في"الفهرسة"، والإفراني في"الصفوة"، والقادري في"نشر المثاني"، والكتاني في"السلوة"، وابن المؤقت في"السعادة الأبدية"، ومحمد حجي في الزاوية الدلائية، والمختار السوسي في"المعسول"، وأحمد الولالي في"مباحث الأنوار"..

قال الإفراني في"صفوة من انتشر"بشأن محمد بن سعيد المرغيثي:"كان رحمه الله إماما في علوم الحديث والسير، له اليد الطولى في ذلك، وإليه المرجع فيما هنالك، مع المشاركة في العلوم الأُخر، والدين المتين والورع التام، وكان محترما معظما عند الخاصة والعامة"، ويذكر اليوسي في المحاضرات أن المرغيثي ورد على الشيخ بناصر الدرعي بزاويته بتامكروت مما يدل على تعدد مشاربه العلمية والصوفية ..