ويفيدنا العلامة محمد المختار السوسي في"المعسول"أن من أشياخ محمد المرغيثي سيدي عبد الواحد بن عاشر، وسيدي عبد الهادي، وسيدي العربي الفاسي، وسيدي محمد الجنّان صاحب حاشية خليل، وأخذ المرغيثي أيضا عن أبي القاسم الغول -تلميذ أبي المحاسن يوسف الفاسي-، وعن أبي مهدي السكتاني، وعن أحمد السالمي المراكشي، ونستفيد من كتاب"مباحث الأنوار"للولالي أن عمدة المرغيثي في التصوف هو الشيخ الشهير محمد بن عبد الله السوسي دفين مراكش.

ويقول الشيخ أحمد الولالي"مباحث الأنوار في مناقب بعض الأخيار" (تحقيق عبد العزيز بوعصاب) : (ص: 204 - 205) :"أن المرغيثي كان يرى صحة صحبة رجال حاح استنادا إلى رأي أستاذه السوسي ( .... ) وكان الناس يقصدونه بالزيارة والتبرك ولهم فيه اعتقاد عظيم، وهو الذي وضع نظما في علم التوقيت وشهور العام وأيامه، سماه"المقنع"، وشرحه بشرحين: الكبير والصغير. وقد جعل الله تعالى الإقبال على كتابه، فاشتغل به الناس في المدائن والقرى ببركة صحة نصحه وصلاح طويته، ووضع في الجدول المخمس خالي الوسط نظما وقع الإقبال عليه أيضا"..

وكانت للمرغيثي دراية في عدة فنون منها علم الطب، ثم إنه ترك الطب بسبب أن إنسانا أتى بالهراقة فيها بول وأدخلها عليه المسجد، فقال: إن علما يؤدي بي إلى أن أكون سببا لدخول المسجد بالنجاسة لا أشتغل به!!! وقد كان مقصودا به قبل ذلك .. وهذا ما يؤكده المرحوم الأستاذ عبد الصمد العشاب في مقاله"مساهمة علماء المغرب في ميدان الطب"