عرف الشيخ محمد المنتصر الكتاني بعلمه الموسوعي واطلاعه النادر، كما كان من أبرز المفكرين المعرفين بالتراث الأندلسي والفقه الظاهري، والمنظرين لنظام الدولة الإسلامية، والاقتصادي الإسلامي.
وهو صاحب فكرة"موسوعة الفقه الإسلامي"في مصر، بل يعد من أول من دندن حولها في العالم الإسلامي، وكان المقصود منها: تيسير الوصول إلى مظان الفقه الإسلامي، خاصة المذاهب الفقهية غير المتبوعة والمنقرضة، وذلك لتيسير إحياء الحكم بالشريعة الإسلامية كما كان الحال في أيام الخلافة الإسلامية المزدهرة.
ترك مؤلفات كثيرة في مختلف الفنون منها:"معجم فقه الظاهرية"في مجلدين باسم موسوعة الفقه الإسلامي، ثم ألف:"معجم فقه السلف: صحابة وتابعين وعترة"في تسعة أجزاء طبعتها جامعة أم القرى عام1406، تقديم وتحقيق لكتاب جده:"الرسالة المستطرفة".و"فاس عاصمة الأدارسة". و"ترجمة الإمام مالك". وترجمة الحافظ ابن حزم الأندلسي. و"تخريج أحاديث كتاب"تحفة الفقهاء"في فقه الأحناف"لأبي الليث السمرقندي، بالتعاون مع العلامة الدكتور وهبة الزحيلي. طبع في مجلدين. و"شرح وتخريج مسند"