أما علاقة ابن باجة بالفارابي فقد انبرى ليعالج المسألة الدكتور ماجد فخري في تحقيقه لـ"تعاليق ابن باجة على منطق الفارابي" (دار الشروق، بيروت، طبعة: 1، 1994) ، ويتصدر المجموعة المنطقية للفارابي-والتي اهتم بها ابن باجة أيما اهتمام- طائفة من التعاليق على ما يمكن دعوته"بكتب التوطئة"عن الفارابي، ومعروف أن الفارابي قد ألف عددا من هذه الكتب هي"المدخل أو إيساغوجي".

يقول الدكتور فخري أن أبا بكر بن الصائغ المعروف بابن باجة توفر، بوجه خاص على نهج أبي نصر الفارابي (تـ 950م) دون سواه، إن في فلسفته الخلقية والسياسية أو في المنطق. وقد أقبل الفيلسوف ابن باجة على تدبر منطق الفارابي والتعليق على أجزائه المختلفة في سلسلة من النصوص كان شرع في نشرها الدكتور ماجد فخري، وقد أتبث الأستاذ جدولا بالآثار الفارابية الوارد ذكرها في مؤلفات ابن باجة، المطبوع منها والمخطوط .. وقد استعان الباحث بذلك على التثبت من صحة نسبة مجموعة من الأعمال للفارابي، لاسيما أن عددا لم يكشف عنه حتى الآن .. وهذا عمل علمي كبير ..

ومن أهم الآثار الفارابية التي شرحها صاحبنا ابن باجة كتاب"الأخلاق إلى نيقوماخس"الذي يدعوه كل من الفارابي وابن باجة نيقوماخيا .. فقد نسب ابن النديم في"الفهرست"إلى الفارابي"تفسير قطعة من كتاب الأخلاق"لأرسطو طاليس .. ومع أنه ليس من اليسير التحقق من الجانب الذي شرحه الفارابي من كتاب"الأخلاق إلى نيقوماخس"؛ فإن