والاتصالات التي جرت، تعهدت الولايات المتحدة بأن تبقى منطقة النقب في حدود الدولة اليهودية كما تعهدت بالاعتراف بالدولة اليهودية العتيدة. وفي برقية بعث بها فايتسمان إلى أعضاء الإدارة الصهيونية طالبهم بالإعلان فورًا عن إقامة دولة إسرائيل، وفعلًا أعلن دافيد بن غوريون عن إقامة الدولة في ذلك اليوم.

الرئيس فايتسمان يؤدي اليمين الدستوريةتلقى فايتسمان برقية من البلاد بتاريخ 17.5.1948 دُعيَ فيها ليترأس مجلس الدولة المؤقت لدولة إسرائيل. إننا نهنؤك بمناسبة إقامة دولة إسرائيل إذ كنت تعمل أكثر من أي شخص آخر على إقامتها. عزز وقوفك ومساعدتك جميعنا. إننا نتطلع إلى اليوم حيث ترئس الدولة التي ستقام بسلام.

في شهر شباط فبراير عام 1949 يوم تأسيس الكنيست انتُخب فايتسمان أول رئيس لدولة إسرائيل وقال في خطابه بهذه المناسبة: يتوجب علينا بناء جسر جديد بين العلم وروح الإنسان. عرفت دومًا إن هناك قيمًا رفيعة فوق العلم ولا يمكن معالجة أدواء الإنسانية إلا من خلالها. هذه القيم من العدالة والاستقامة، السلام والأخوّة. في الصدق والعدل ستفدى صهيون.

الرئيس فايتسمان وأول حكومة في إسرائيل

نظرًا لكون منصب رئيس الدولة ذا طابع شكلاني وبسبب حالته الصحية الرديئة لم يتمكن فايتسمان من المشاركة الفعالة في صياغة سياسة الدولة الجديدة.

في شهر تشرين الثاني نوفمبر عام 1949 بمناسبة عيد ميلاده ال 75 تم توسيع معهد زيف ودشن فايتسمان معهد فايتسمان للعلوم بموافقة عائلة زيف وبتأييدها.