في الوقت ذاته كيانا مستقلا يخضع لإشراف الأمم المتحدة، إلا أن إسرائيل قامت باحتلال المنطقة الغربية للقدس والمنطقة الشرقية لها (المدينة القديمة) في حرب الشرق الأوسط الأولى والثالثة، وشهد عام 1980، تصديق الكنيست الإسرائيلي على مشروع قرار، معلنا أن القدس عاصمة دائمة الإسرائيل لا يمكن تقسيمها، وفي هذا الصدد أعرب عرفات بوضوح بعد توقيع إسرائيل وفلسطين على بيان الحكم الذاتي المؤقت المعني بإقامة الدولة الفلسطينية وعاصمتها القدس في المستقبل. وفي هذا الإطار طرح عرفات أثناء زيارته للدول الأوربية في نهاية عام 1993، دعوته"باحقية فلسطين وإسرائيل في القدس. وتجدر الإشارة إلى أن مسألة تحديد الوضع النهائي للقدس لا تحكمها العلاقات الإسرائيلية الفلسطينية فحسب، إنما ستعتبر أيضا قضية حساسة ومحل اهتمام شديد من جانب معتنقي اليهودية وبضع عشرات الملايين من المسلمين نظرا لمكانتها المهمة بالنسبة لأهم الديانات في العالم."

قضية اللاجلين تشرد بضعة ملايين من عرب فلسطين عن موطنهم من جراء قيام الدولة الإسرائيلية وحروب الشرق الأوسط التي شنتها إسرائيل، فهؤلاء المشردون أصبحوا لاجئين. ان قضية اللاجئين تزداد خطورة يوما بعد يوم مع طول فترة الصراع العربي الإسرائيلي: فعدد اللاجئين يزداد تدريجيا، كما تدهورت الظروف الحياتية للاجئين على نحو متزايد. ورغم أن الدول العربية تولي اهتماما بهذه القضية وتساندها، كما أسست الأمم المتحدة خصيصا لهؤلاء وكالة الإغاثة والتشغيل اللاجئين الفلسطينيين في الشرق الأوسط واختصارها (UNRAWA) ، وقامت بدفع كمية ضخمة من الأموال وقدمت كمية كبيرة من مواد الإغاثة لتحسين ظروف