و تنفذ جماعة المجاهدين سيايتها الدعوية من خلال جمعيتين أقيمتا لخدمة العمل الدعوي في البوسنة و الهرسك ، و هاتان المؤسستان هما:
الجمعية الأولى: جمعية الشباب المسلم:
جميع أعضائها بوسنويو الأصل و المولد و المنشأ ، و تجمع بينهم رابطة الدعوة إلى الكتاب و السنة على منهج سلف الأمة ( السلفية ) ، و هم جميعًا ممن تربى في صفوف المجاهدين أو تأثر بهم ، و ارتضى منهجهم و أخذ على عاتقه الدعوة إليه .
و للجمعية اليوم فروع و أعضاء في مختلف مناطق البوسنة ، و تأثير واضح في المجتمع ، حيث يجوب أعضاؤها البلاد طولًا و عرضًا ، داعين إلى الله بالحكمة والموعظة الحسنة ، بالكلمة و الكتاب و المنشورات النافعة .
كما تصدر الجمعية مجلة ( الصف ) الإسلامية من فينا ( بالنمسا ) .
و توزع منها نحو عشرة آلاف نسخة شهريًا ، كما تنشر من خلال شبكة الانترنت لتصل إلى المسلمين البوشناق المهاجرين حيث كانوا .
الجمعية الثانية: جمعية الفجر الخيرية:
تقوم على هذه الجمعية مجلس إدارة من المجاهدين العرب يرأسه أميرهم ، وينضوي في عضويتها عدد من الدعاة و مدرسي العلوم الشرعية في الدورات الأربع التي سبقت الإشارة إليها .
و يتركز نشاط هذه الجمعية في جانبين:
الأول: إعداد الأئمة و الدعاة من أبناء البوسنة ، سواءًا كان ذلك بتنظيم الدورات الشرعية لهم ، أم استضافة الدعاة و العلماء من البلدان العربية ( و خاصة جزيرة العرب ) خلال فصل الصيف ، و شهر رمضان من كل عام .
الثاني: الاتصال بالهيئات الخيرية و المؤسسات الإغاثية الإسلامية و التنسيق مع الجهات الأخرى ، بغرض تأمين الدعم المادي اللازم لتمويل ، و كفالة الدعاة البوسنويين.