انتهت هذه الحفريات سنة 1969، وقد جرت على امتداد (80) مترًا آخر من سور الحرم الإسلامي القدسي،مبتدئة حيث انتهت المرحلة الأولى،ومتجهة شمالًا حتى وصلت أحد أبواب الحرم الشريف المسمى (باب المغاربة) مارة تحت مجموعة من الأبنية الإسلامية الدينية التابعة للزاوية الفخرية (مركز الإمام الشافعي) وعددها (14) صدعتها جميعها وتسببت في إزالتها بالجرافات الإسرائيلية بتاريخ 14/6/1969م وإجلاء سكانها. ويقول عالم الآثار اليهودي (مائير بن دوف) أنّه اكتشف أساسيات ثلاثة قصور أموية اثنان منها متشابهان والثالث يختلف قليلًا عن سابقيه.

المرحلة الثالثة:-