2ـ عطاء الجليل في مختصر الشيخ خليل، في الفقه
3ـ تحقيق الإبانة في صحة إسقاط ما لم يجب من الحضانة، في الفقه، مطبوع ( تحقيق ودراسة: د. يحيى أحمد الجردي، المدينة النبوية: مكتبة الغرباء الأثرية، 1414هـ) . ويورد فيه أحكام الحضانة في الفقه المالكي، وينظم بعض هذه الأحكام شعرا لتيسير حفظها. ويؤخذ على هذا الكتاب أنه يخلو من النصوص من الكتاب والسنّة وأنه يعتمد على المراجع المتأخرة.
4ـ الدرر المنيفة في الفراغ عن الوظيفة، في الفقه. وقد اطلعنا على هذه المخطوطة بالخزانة العامة بالرباط (رقم د 194) ، وهي تتعلق ببعض أحكام الوقف.
5ـ الجواهر المنتثرة في هبة السيد لأم الولد والمدبرة، في الفقه
6ـ دُرر النفائس في شأن الكنائس
7ـ رسالة في بعض أحكام الوقف، في الفقه
8ـ رسائل في الفقه
9ـ شرح التهذيب
10ـ شرح مختصر ابن الحاجب
11ـ إحكام التحقيق بأحكام التعليق
12ـ الدراري في ترتيب أبواب صحيح البخاري، وهو فهرس أبواب صحيح البخاري ويقع في 140 ورقة مخطوطة.
13ـ الدر الفريد في الكلام على مواضع من كلام الله المجيد
14ـ شرف البدر بضياء ليلة القدر
15ـ توشيح الديباج وحلية الابتهاج، في التراجم؛ مطبوع . (تحقيق وتقديم: أحمد الشتيوي، تونس: دار الغرب الإسلامي 1403/1983) وهو ذيل لكتاب (الديباج المُذهّب في معرفة أعيان علماء المَذهب) ، أي المذهب المالكي، لمؤلفه برهان الدين إبراهيم بن علي المشهور بـ"ابن فرحون". ويشتمل الذيل الذي وضعه القرافي على نحو 327 ترجمة.
16ـ التحرير الفريد في تحقيق التوكيد والتأكيد
17ـ القول المأنوس بتحرير ما في القاموس، وهو حاشية على معجم (القاموس المحيط) للفيروزابادي، طُبع نبذ منها بهامش (القاموس المحيط) طبعة بولاق 3/1301.
18ـ بهجة النفوس بين الصحاح والقاموس، في اللغة
19ـ توالي المنح في أسماء ثمار النخل ورتبة البلح، وهي المخطوطة التي نحققها هنا.