فهرس الكتاب
والأمر الذي يستوقف في هذا الصدد هو تفريق النديم بين حالتين ربما تكونان متشابهتين، فبينما ذكر عن كتاب"النحل"أنه"بخط السكري" (ص 61) أشار إلى كتاب"التشريح الكبير"لجالينوس أنه"بنقل حبيش" (ص 349) ، ولم يبين في تضاعيف كتابه الفرق بين هاتين المفردتين إذا كانتا تؤديان معنيين مختلفين.
مشكلات الاستشهادات المرجعية في الفهرست
حفلت استشهادات النديم في الفهرست بكثير من الاضطرابات التي يمكن تصنيفها في فئات ثلاث هي: مشكلات في الأسماء، ومشكلات في الإحالات ذاتها، ومشكلات عامة.
مشكلات الأسماء
يعاني بعض استشهادات النديم من اضطراب في ذكر الأسماء عند الإحالة. فقد أشار على سبيل المثال إلى قول لأحمد بن إسحاق (ص 25) ، ولا يعرف يقينا هل المقصود به أحمد ابن إسحاق الموصلي أو غيره. كما أحال في الصفحة نفسها إلى أحمد بن عبد الله، ولا يعرف هنا من هذا الشخص، أهو أحمد بن عبد الله بن سلام الذي سبقت الإشارة إليه في (ص 24) أم شخص آخر. وفي إشارة مرجعية أخرى كتب النديم:"حدثني أبو الحسن محمد بن يوسف ... قال حدثنا أبو عبد الله ... قال حدثنا أبو محمد ... قال حدثنا بكر ... قال حدثني الواقدي ... قال حدثنا معمر ... عن الزهري عن محمد ... قال ..." (ص 28) ، دون أن يذكر من الذي حدثه، هل هو أبو الحسن محمد بن يوسف الناقط الذي ورد ذكره في موضع سابق (ص 27) وفصلته عنه إشارة مرجعية مختلفة، أم غيره؟