أصبحت حركة الإخوان نشيطةً ثانيةً أثناء الانتفاضة الفلسطينيّة وأنشأت حركة المقاومة الإسلامية: حماس (*) بزعامة أحمد ياسين (*) . منذ ذلك الحين أصبحت الحركة نشيطة جدًا في قتال الاحتلال الإسرائيلي في الأراضي المحتلة وشنّت العديد من الهجمات العنيفة. كانت نشيطة جدّا أيضًا في تزويد الفلسطينين بالخدمات الاجتماعية والخدمات الطبية. رفضت اتفاقيات أوسلو وكلّ الاتفاقيات الموقعة بين السلطة الوطنية الفلسطينيّة وإسرائيل. راجع أيضًا حركة المقاومة الإسلامية: حماس؛ حزب التحرير الإسلامي؛ إسرائيل؛ الجهاد الإسلامي في الضفة الغربية وقطاع غزة؛ الشقاقي، فتحي؛ خياط، عبد العزيز.
الإخوان المسلمون في الكويت. راجع جميعة الإصلاح الاجتماعية في الكويت؛ الإخوان المسلمون في الخليج.
الإخوان المسلمون في لبنان. راجع الجماعة الإسلامية في لبنان.
الإخوان المسلمون في ليبيا. تعود حركة الإخوان المسلمين في ليبيا إلى أوائل الخمسينات بسبب تأثرها بالإخوان المسلمين المصريين (*) . في ليبيا، حصدت حركة الإخوان المسلمين دعم الطلاب وخريجي المدارس الدينية والحديثة. اخترقت المنظمة ثلاث فئات، الفئة الأولى أصبحت ناصرية، الفئة الثانية أبعدت نفسها من أيّ نشاط سياسي وحصرت نفسها في ممارسة الدين. الفئة الثالثة واصلت تقاليد الإخوان المسلمين نفسها. ومع موقف النظام الليبي من الإصلاح الديني الإسلامي، أصبحت حركة الإخوان المسلمين إحدى قوى المعارضة السياسية الرئيسية ضدّ النظام الثوري تحت قيادة الجبهة الوطنية لإنقاذ ليبيا (*) . راجع أيضّا الجبهة الوطنية لإنقاذ ليبيا.
الإخوان المسلمون في موريتانيا. راجع حزب الأمة في موريتانيا.
الإخوان المسلمون في اليمن. راجع التجمع اليمني للإصلاح؛ الورتلاني، الفضيل؛ الزنداني، الشيخ عبد المجيد.