ومع قدوم السلطة الفلسطينية إلى أرض الوطن عام 1994 انخرط عدد كبير من عناصر الجبهة في صفوف أجهزة السلطة الفلسطينية ولم يتبق من مجموعاتها العسكرية شيء إلى أن اندلعت انتفاضة الأقصى عام 2000 وبدأت قوى المقاومة الفلسطينية في إعادة تشكيل وترتيب عناصرها واستجماع عناصر قوتها وطاقاتها حيث شكلت الجبهة الديمقراطية جناحًا عسكريًا لها أسمته"كتائب المقاومة الوطنية الفلسطينية"تولى تنفيذ عدد من العمليات العسكرية ضد قوات الاحتلال والمستوطنين، كان من أبرزها العملية الجريئة التي استهدفت موقعًا عسكريًا في مجمع مستوطنات"غوش قطيف"جنوب قطاع غزة مما أدى إلى مقتل 3 جنود صهاينة وجرح 7 آخرين.

وقد وقفت الجبهة الديمقراطية موقفًا معارضًا للعمليات الإستشهادية في عمق الكيان الصهيوني مشددة على مشروعية الفعل العسكري ضد قوات الاحتلال والمستوطنين داخل فلسطين المحتلة عام1967.

ومع ذلك يبقى دور الجبهة الديمقراطية العسكري إبان انتفاضة الأقصى محدودًا ولا يرقى إلى حجم المشاركات الكبرى التي تنفذها القوى الرئيسية للمقاومة الفلسطينية.

لجان المقاومة الشعبية, ألوية الناصر صلاح الدين/

تعرّف لجان المقاومة الشعبية في فلسطين نفسها بأنها إطار شعبي كفاحي مقاتل مستقل بذاته تأسس منذ الشرارة الأولى لاندلاع الانتفاضة بتاريخ 28/9/2000 بهدف مقاومة الاحتلال والحفاظ على جذوة الانتفاضة والمقاومة واستمراريتها بزخم كفاحي وانتفاضي ينسجم مع قرار هذه اللجان بأن الانتفاضة والمقاومة هي خيار استراتيجي وخيار الشعب الفلسطيني لكنس الاحتلال وتحقيق كامل أهداف الشعب الفلسطيني المشروعة.