اشتهر محمد بن سعيد المرغيثي بكتابه"المقنع في اختصار علم أبي مقرع"وهي في علم التوقيت، وقد شرحها بشرحين مفيدين .. وله رسالة شوق إلى الرسول:"فهرست العوائد المزرية بالموائد": مخطوط الخزانة الوطنية بالرباط رقم: 285 د، وله منظومة في الوفق المخمس، شرحها العلامة أحمد سكيرج في حدود عام 1309هـ، وكان عمره وقتذاك 14 سنة!!، ويعتبر شرحه من أهم وأدق الشروح التي عرفتها هذه المنظومة العلمية، وعلى رغم صغر سن اسكيرج فقد أتى فيه بالعجب العجاب، لكن العلامة سكيرج أعرض عن هذا الفن بعد اعتناقه للطريقة التجانية عام 1315هـ، كما قام بتمزيق معظم التقاييد التي جمعها أو ألفها في هذا الفن، ولم يسلم من التمزيق سوى بعض النسخ التي كانت عند بعض أصحابه على سبيل الإعارة ...

شرح محمد بن سعيد المرغيثي منظومته"المقنع في اختصار علم أبي مقرع"بشرح سماه"الممتع في شرح المقنع (المطبعة الثعالبية بالجزائر 1908، الذي يقول في مقدمته:"الحمد لله الذي من علينا بيسارة علم أوقات الليل والنهار، وأنعم بفضله ومنه باقتطاف أزهار روضة الاعتبار، وزين السماء الدنيا بمصابيح وجعلها رجوما لكل شيطان غرار، وقدر فيها أنواع السير فكل على مشيئته سائر وجار، لتعلموا عدد السنين والحساب، ولتهتدوا بها في ظلمات البر والبحر عند السفر والذهاب، رحمة منه وفضلا، فهو الرحيم الوهاب( .... ) وبعد، فيقول أحوج العبيد إلى عفو ربه الكريم محمد بن سعيد بن محمد بن يحيى بن أحمد بن داود بن أبي بكر بن يعزى السوسي المرغيثي هذا شرح لطيف قصدت به تبيين رجزنا