أما انقسام الروم الملكيين إلى كاثوليك وأرثوذكس، فتقول المصادر المسيحية أنه يعود إلى عام 1724م، إذ أعلن قسم منهم الوحدة مع روما (الفاتيكان) وأطلق عليهم"الروم الملكيون الكاثوليك"، في حين ظل القسم الآخر، وهو الأكبر، بعيدًا عن روما وعرفوا بـ"الروم الأرثوذكس". واعترفت الدولة العثمانية بهذا الانفصال وثبّتته رسميا سنة 1837، بفرمان السلطان محمود الثاني.

و الروم الأرثوذكس المقيمون في المنطقة العربية يقدر عددهم بمليون ونصف المليون نسمة أو أكثر قليلا، ويتوزعون على ثلاث بطريركيات:

1-بطريركية أنطاكية وسائر المشرق:

مقرها الحالي في العاصمة السورية دمشق، وأتباعها متوزعون في سوريا ولبنان والعراق وأوربا وأمريكا وأستراليا. ويرأس هذه الكنيسة حاليا اغناطيوس الرابع هزيم، وهو من مواليد سوريا عام 1921، وقد انتخب في منصبه هذا سنة 1979.

والروم الأرثوذكس في سوريا أكبر الطوائف المسيحية، وتصل نسبتهم إلى 70 % من مجموع المسيحيين، وتعتبر مدينة دمشق أكبر تجمع للأرثوذكس في سوريا.

2-بطريركية الاسكندرية وسائر إفريقيا:

وهي كنيسة صغيرة، مقرها في مدينة الإسكندرية في مصر، والبطريرك وغالبية أفراد الإكليروس يونانيون. والبطريرك الحالي الذي يحمل لقب"بابا"هو ثيودوروس الثاني وهو من مواليد كريت في اليونان في سنة 1954 وانُتخب في منصبه في أكتوبر 2004.

ويبلغ عدد الكنائس الأرثوذكسية في الإسكندرية والقاهرة في الوقت الحاضر 18 كنيسة وهناك كنائس في دمياط وبورسعيد وطنطا والمنصورة. وبسبب نشاط المبشرين بالأرثوذكسية في أفريقيا، انتشرت الكنائس أيضا في تونس والسودان وليبيا، ودول أخرى.

3-بطريركية أورشليم (القدس) :

وتعرف أيضًا بكنيسة الروم الأرثوذكس في القدس، وكنيسة القدس الأرثوذكسية. ويعتبرها المسيحيون الأرثوذكس الكنيسة المسيحية الأم.