وعن علاقته بحركة الجهاد الإسلامي، يقول التعمري: المجتمع، وكذلك القوى الإسلامية والوطنية الفلسطينية، وحتى سلطات الاحتلال تعاملت معي كقائد في حركة الجهاد، وهذا نابع ربما من قربي النضالي من هذه الحركة بعد خروجي من حركة فتح .. هذه العلاقة بقيت في إطار من التعاطي النضالي المشترك لا أكثر ولا يعني هذا اضطلاعي بأية مسؤولية في هذا التنظيم .."إنني أؤكد أن الجهاد الإسلامي ليست لها أية علاقة بموضوع تشيعي".

ويؤكد أبو أحمد، الناطق الإعلامي لحركة الجهاد الإسلامي، في حديث هاتفي مع"الغد"، أن"محمد شحادة التعمري لا يمثل إلا نفسه، فهو لا يمثل حركة الجهاد الإسلامي في فلسطين لا من قريب ولا من بعيد ... مؤكدًا على أن كوادر الجهاد الإسلامي في الضفة الغربية والقطاع ملتزمون بقرار الحركة بمقاطعة الانتخابات ترشحًا وتصويتًا، وأن الحركة هي في النهاية حركة سنية وليست شيعية ورؤيتها ومعالمها وأهدافها واضحة للصغير وللكبير."