وثمة تقارب مصري إيراني آخر في قضية هامة شغلت العالم أجمع وهي قضية صراع الحضارات, فقد أكدت مصر وإيران على ضرورة"تجنب الصدام بين الحضارتين الغربية والإسلامية". ومن الشواهد على حدوث التقارب بين البلدين, تحذير الدولتين للولايات المتحدة بشأن استمرار العمليات العسكرية الأمريكية ضد أفغانستان لأنها سوف تزيد من الفجوة بين العالم العربي والإسلامي والولايات المتحدة, وأن العمليات العسكرية لن تنجح بالضرورة في القضاء على الإرهاب.

والشيء اللافت للنظر ما قامت به إيران من إدانة في 17/8/2002 على لسان المتحدث باسم وزارة الخارجية حميد رضا اصفي لقرار إدارة الرئيس الأمريكي جورج بوش بعدم تخصيص مساعدات إضافية لمصر احتجاجًا على سجن الدكتور سعد الدين إبراهيم بقوله إن"هذا تدخل فاضح في شؤون مصر الداخلية".

ومما يؤكد إصرار الجانبين على استمرار توطيد علاقاتهما ما صرح به السيد أحمد ماهر وزير الخارجية المصري بأن الاتصالات بين مصر وإيران مستمرة باعتبارهما أهم دولتين في المنطقة, وأن العلاقات بينهما تسير في الطريق الصحيح بعد أن شدد على أهمية أن يتخذ البلدان خطوات إضافية وتمهيدية من الجانبين لتطبيع العلاقات موضحًا أن المشاورات المصرية الإيرانية ستستمر في كل مناسبة يتاح فيها التشاور.