خلف المالقي مصنفات عديدة في الفقه وعلوم القران أجلها"الدر النثير"موضوع هبن ا البحث ، وله كتاب"الأصول الخمسة التي بني الإسلام عليها"و"المنتخب في فضائل القران" (5) وغيرها.

توفي سنة 705 هـ، بمقالة، وكان الحفل في جنازته عظيما.

كتاب"الدر النثير":

شرح المالقي بهذا الكتاب كتاب"التيسير"لأبي عمرو الداني (ت 444 هـ) ، وهو العمدة في علم القراءات القرآنية، عنه نظم الشاطبي قصيدته المشهورة"حرز الأماني ، فصار الفرع أشهر من الأصل ، إذ غدت الشاطبية طريق القراءات القرآنية لا يكاد يؤخذ إلا بها."