كانت بداية نشأة قسم الاقتصاد الإسلامي بجامعة أم القرى عبارة عن تطبيق عملي لتوصية أوصى بها المؤتمر العالمي الأول للاقتصاد الإسلامي والذي عقد بمكة المكرمة -حرسها الله- عام 1396 هـ؛ حيث اتخذ مجلس الجامعة الموقر في جلسته التاسعة التي عقدت في 29/ 8/1401 هـ قرارًا بإنشاء قسم الاقتصاد الإسلامي على أن يكون تابعًا لكلية الشريعة والدراسات الإسلامية بالجامعة، مساهمة من الجامعة في تحقيق الرغبة الملحة لإيجاد النظام الاقتصادي الإسلامي، والكوادر العلمية المؤهلة في هذا المجال؛ انطلاقًا من أن الاقتصاد الإسلامي هو جزء من شريعتنا الغراء التي تنظم جميع جوانب حياة البشرية، وإنقاذًا للإنسانية من المشكلات الاقتصادية المعقدة التي نشأت بسبب التعامل بالنظام الاقتصادي الوضعي الذي قوامه الربا.

سارت الدراسة في القسم بداية على نظام الساعات المعتمدة وهو النظام العام في لجامعة آنذاك واشتملت الخطة الدراسية للقسم على (138) وحدة معتمدة يجب أن ينهيها الطالب قبل التخرج تشتمل على متطلبات الجامعة ومتطلبات الكلية ومتطلبات القسم (1) .، ثم رُفع عدد الوحدات الدراسية بعد التحول لنظام اليوم المعتاد لتصبح (158) وحدة معتمدة قسمت إلى ثمانية مستويات في أربع سنوات، ويتراوح عدد الوحدات الدراسية في كل مستوى من (21) وحدة كحد أقصى و (19) وحدة كحد أدنى.

(1) انظر: خطة القسم المرفقة للمرحلة الأولى ملحق رقم (11) .