البريطاني حماية لآل خليفة من أي اعتداء خارجي, وقد استمرت البحرين تحت الاحتلال البريطاني حتى العام 1971, حين تم استقلالها في ذلك العام.

وقد مرت العلاقة بين الطرفين بالعديد من المحطات المهمة منذ حصول البحرين على استقلالها في العام 1971, فقد عارضت إيران استقلال البحرين بعد رحيل الاستعمار البريطاني وأصرت على تبعيتها لها, وانتهت هذه المشكلة بإجراء استفتاء شهير على استقرار البلاد صوتت لصالحه الأغلبية الكاسحة من الشعب البحريني, بما فيه الشيعة الذين أخذوا ضمانات من قبل آل خليفة بتأسيس نظام سياسي عصري يتيح الفرصة لمشاركة كافة فئات الشعب, ولعل ذلك كان أحد الأسباب الرئيسية في هذه التجربة الديمقراطية الرائدة التي عرفتها البحرين بعد الاستقلال, والتي سرعان ما انهارت بعد قرار الأمير الشيخ عيسى بحل المجلس الوطني المنتخب عام 1975 قبل أن يعقد دورته السنوية الثانية.

وكانت المرحلة الأهم من تاريخ العلاقة بين البلدين قد بدأت بعد قيام الثورة الإسلامية في إيران عام 1979, حيث كان للثورة وبحكم علاقات الطرفين تأثيرات كبيرة على الوضع في البحرين وخاصة بالنظر إلى شعار تصدير الثورة الذي رفعته الجمهورية الإسلامية الإيرانية خلال العقد الأول من الثورة, والتي كانت البحرين أول هدف له, ومنذ هذا الحدث الضخم مرت العلاقات البحرينية الإيرانية بالكثير من العواصف.