استشارة للنظام حول مشكلة معينة مع المعرفة الموجودة في قاعدة المعرفة بهدف استنتاج حقائق جديدة تدخل الذاكرة العاملة وكذلك الاستنتاجات التي يخرج بها النظام.
وللنظام الخبير قدرة على تفسير التفكير والإدراك أو تفسير الحل الذي يعطيه النظام، لذلك لابد من وجود برنامج للتفسير Explanation ضمن نظام فرعي يقوم بتجهيز الشرح والتفسير الواضح للمستفيد حول الاسئلة والاستنتاجات الخاصة بحل مشكلة معينة. إن عمل آلة الاستدلال في فحص القواعد يتم بموجب صيغتين هما الاستنتاج الأمامي والاستنتاج الخلفي. (Alter,1999,328)
ففي الاستنتاج (التفكير) الامامي Forward Reasoning والذي يسمى أيضًا تسلسل للإمام Forward chaining يتم تفحص القواعد في ترتيب معين الواحدة تلو الأخرى حسب التتابع الذي أدخلت فيه القواعد أو حسب ما يحدده المستفيد، يحاول النظام الخبير تقويم ما إذا كان الشرط صحيحًا أو خطأ مع فحص كل قاعدة من القواعد وهكذا تستمر عملية الفحص حتى يكتمل مسار كامل خلال فئة القواعد كلَها ويمكن أن يكون اكثر من مسار واحد لتحديد قيمة المتغير.
أما في حالة الاستنتاج (التفكير) الخلفي Backward Reasoning تقوم آلة الاستدلال بأختيار قاعدة وتنسبها إلى المشكلة المراد حلها وبذلك يتحدد قيمة لمتغير الهدف. ثم تتناول آلة الاستدلال مشكلة فرعية أخرى (Stair & Reynolds,2003,473) ومما تجدر الإشارة إليه انه لا توجد آلة استدلال نموذجية أو شاملة لكل أنواع الأنظمة الخبيرة بل هي تصمم على وفق مجال محدد للتطبيق شرط امتلاك المعرفة ضمن نفس المجال وحسب خواص المشاكل المراد حلها.
يتم التفاعل بين النظام الخبير والمستفيد من خلال لغة تخاطب طبيعية Natural Language تعتمد أسلوب الحوار المبسط وصولًا إلى الحل المطلوب للمشكلة من حيث آلية الاستنتاج والتفسير والإيضاح والمرونة المطلوبة لإضافة معارف جديدة أو إجراء تعديلات أثناء تطور حل المشكلة (G,raham,1998,502) . ومن خلال هذا الحوار يتمكن المستفيد من طرح سلسلة من الاسئلة لكي يتلقى الاجابات عن المشكلة المطروحة، وفي الواقع تصمم الواجهات البينية للانظمة الخبيرة على أساس تلبية احتياجات المستفيد النهائي (ياسين 2004،196) .
إن المستفيد يتلقى المعلومات من الواجهة البينية للنظام الخبير في موقع العمل بصيغة استعلامات وحقائق أو خلاصات واستنتاجات فضلًا عن أن المستفيد يتمكن من استخدام عناصر أخرى عند التحاور مع الواجهة مثل القوائم والصور والأشكال والأصوات وأنماط التعبير المختلفة. وإذا كان تصميم واجهة المستفيد هو لتسهيل الحوار في اتجاهين بين المستفيد والنظام، ففي هذه الحالة سيصبح هنالك مدخلات النظام الخبير والمخرجات. المستفيد يتمكن من إدخال المعلومات المطلوبة باستخدام لوحة المفاتيح أو الماوس أو أي نوع آخر من تقنيات الإشارة وحتى استخدام الرسوم بما يشبه النافذة مثل استخدام الشاشة لتجميع آلة معينة أو دمج أشكال بطرق مختلفة لانتاج تصميم شاشة متكاملة (Mecleod 1998,635) أما المخرجات فهي تتمثل