المحكمة العليا, و لجنة مستقلة خاصة التي تدعوا للاجتماع, مجلس شيوخ صناع القرار الطارئ.

في جانفي/يناير 2002 بتوكيو, المتبرعون الدوليون تعهدوا بأكثر من 4.5 بليون دولار لجهود إعادة البناء. و الأطراف التي حضرت ببون أيضا طلبت الأمم المتحدة"مراقبة و مساعدة تطبيق كل سمات"الاتفاقية. إلى تلك النهاية, قرار مجلس الأمن 1401, مرر في 28 مارس/اذار 2002, أسس مهمة الأمم المتحدة للمساعدة بأفغانستان ( UNAMA ) . بالإضافة , وافقت المملكة المتحدة لتكون الأمة الرئيسية لمكافحة المخدرات, أطاليا للعدالة, الولايات المتحدة للجيش, ألمانيا للشرطة, و اليابان لنزع السلاح, التسريح, وإعادة إدماج المقاتلين السابقين. اجتماع مجلس شيوخ صناع القرار الطارئ الذي حضره 2000 من الناس تقريبا, و حدث بين 12 و 19 جوان/يونيو 2002, بعد تحضير واسع و استشارات شاملة. بالنهاية اختير حميد كرزاي كرئيس للإدارة المتنقلة و رئيس دولة. مرشحيه للمناصب الرئيسية في الإدارة كانوا أيضا مصدق عليهم من قبل مجلس النواب الطارئ. حقائب الدفاع و الشؤون الخارجية أعطيت إلى تحالف شمال أغلبيته التاجيك, بينما وزارة الداخلية ذهبت إلى حاكم باشتون الإقليمي.

عودة الطالبان

في ربيع و صيف 2002, بدأت الطالبان و قوات أخرى شن عمليات هجومية لإسقاط الحكومة الأفغانية و إجبار انسحاب الولايات المتحدة و قوات التحالف. في افريل/ نسيان, على سبيل المثال, قوات الطالبات و الجهاديين شنت سلسة من الهجمات الهجومية في كندهار, خوست, نانقارهار, كابول, و محافظات أفغانية أخرى. أشار هذا إلى بداية التمرد الحديث. بعد 2002 شنت مجموعات التمرد حملات متزايدة في العنف في أفغانستان بالرغم من التقدم السياسي. في جانفي/يناير 2004, على سبيل المثال, تبنى الأفغان دستور جديد. في أكتوبر 2004, انتخبوا حميد كرزاي كرئيس, على الرغم من الجهود من قبل الطالبان و مجموعات تمرد أخرى استهدفت أولئك المشاركين في الانتخابات. في سبتمبر2005, انتخب الأفغان برلمان جديد, الذي شمل عدد من وزراء الطالبان السابقين. على الأقل العديد من الإفراد الذين ارتبطوا الطالبان في السابق ربحوا و مقاعد بمجلس الشيوخ الأدنى (البيت الأسفل للجمعية الوطنية) في انتخابات سبتمبر 2005, شمل ذلك عبد السلام روقيطي, الرئيس حميدكرزاى عين النائب السابق لطالبان وزيرا للشؤون الدينية, مولاوي عرس الله رحمناي.