-مسند حديث سفيان الثوري. شبه مفقود.

-كتاب"الإغراب"ما أغرب فيه شعبة على الثوري، وما أغرب فيه الثوري على شعبة، ويوجد من هذا الكتاب جزء في مخطوطة في (أسكوريال) في أسبانيا الأندلس.

-مسند حديث ابن جريج. شبه مفقود.

-مسند حديث القطان. شبه مفقود.

-مسند حديث الفضيل بن عياض، وداود الطائي، ومفضل بن مهلهل. وهي كلها شبه مفقودة.

-الجرح والتعديل. شبه مفقود.

-مسند علي بن أبي طالب. شبه مفقود، وهو أحد مصادر الإمام المزي في كتابه"تهذيب الكمال".

-تفسير القرآن. مطبوع.

-الجمعة. مطبوع.

-خصائص علي. كتاب مطبوع.

-مناسك الحج على مذهب الشافعي. شبه مفقود.

-تسمية فقهاء الأمصار. مطبوع.

-تسمية من لم يرو عنه غير رجل واحد. مطبوع.

-جزء من حديثه. موجود بالظاهرية بدمشق.

-مجلسان من إملائه، برواية الأبيض الفهري. مطبوع.

-فضائل القرآن. مطبوع.

-مسند منصور بن زادان. شبه مفقود.

-عمل اليوم والليلة. مطبوع.

-شيوخ الزهري. شبه مفقود.

-ذكر من حدَّث عنه سعيد بن أبي عروبة ولم يسمع. منه مطبوع.

-كتاب المدلسين. موجود ضمن كتاب سؤالات السلمي للدارقطني، وضمن كتاب ميزان الاعتدال ذكراه كاملًا.

-أحسن الأسانيد التي تروى عن رسول الله - صلى الله عليه وسلم -. مطبوع.