الله صلى الله عليه وسلم، وفيها الكثير من الكتب النفيسة وروائع المخطوطات، تحولت دون بدل أو عوض إلى مكتبة المسجد النبوي الشريف، والبدل هو رضى رب العالين. وجدير بالذكر أن مكتبة الشيخ محمد العزيز الوزير التونسي رحمه الله تمثل أكبر نسبة من المخطوطات المهداة للقسم كمكتبة الشيخ ياسين خياري
ومكتبة الشيخ أحمد ياسين خياري
فمكتبة الشيخ مصطفى خليفة
ثم مكتبة شيخ المحكمة الشرعية
ومكتبة شيخ المدرسة الصادقية
مكتبة شيخ الروضة الشريفة
مكتبة الوالي طوسون
مكتبة الشيخ محمد العزيز الوزير التونسي
مجموعة مهداة من جلالة الملك عبد العزيز آل سعود
مكتبة الشيخ عبد الكريم المصري الأزهري
مكتبة الدكتور محمد حسين خان بهادر
مكتبة الشيخ عبد الرحمن بن عبد العزيز الحصيِّن
مكتبة مدرسة بروسوي.
هذا بالإضافة إلى بعض المخطوطات المهداة من بعض الأشخاص الفضلاء الخيرين، رحم الله من مات منهم، وحفظ من بقي. وفي المدينة المنورة، مكتبات العلماء والشخصيات، من هذه المكتبات. مكتبة السيد صافي عبد الرحمن. وقفها السيد صافي عبد الرحمن الجفري سنة ألف وثلاثمئة وسبعة وعشرين هـ ألف وثمانمئة وثماني عشر م وهي تحوي أكثر من مئتي مخطوط ووستمئة وثمانية وثمانين مطبوعًا، وتتركز مخطوطاتها في التفسير والقراءات والحديث وأصوله والتاريخ، بالإضافة إلى متفرقات في الفقه والعقيدة والسيرة واللغة والأدب والأدعية والمواعظ.