(1) بعد الضرورة المُلحة على تقديم موسوعة إسلامية مقابل موسوعة ليدن التي صدرت بين عام 1901 م إلى عام 1939 م في أربعة مجلدات مع ملحق خامس، قام عليها عدَّة مستشرقين، وتمَّ نشرها بلغات غربية ثلاث، وقامت الحكومة التركية بترجمتها إلى التركية في الفترة بين عام 1940 م إلى عام 1987 م في خمسة عشرة مجلدًا، وذلك في كلية الآداب في جامعة إسطنبول، واحتوت الموسوعة على أخطاء ودعاوى باطلة على دين الإسلام بعد اطلاع المختصين عليه، وبعد ترجمتها قدَّم الباحثون الأتراك معلومات جديدة لإصلاح الأخطاء الواقعة في الطبعة الأولى، وعند صدور الطبعة الثانية من الموسوعة بين عامي 1954 - 2002 م بقي كثير من الأخطاء ولم تُغيَّر، حينها قرَّر وقف الديانة التركي الذي تأسس عام 1975 م البدْءَ بإنشاء الموسوعة الإسلامية، التي تعتمد على التأليف المباشر من الباحثين الإسلاميين؛ الذين يُشرف عليهم وقف الديانة مباشرة عن طريق توظيفهم وتفريغهم في المركز، ولهذا الهدف تأسست الإدارة العامة للموسوعة الإسلامية التابعة لوقف الديانة التركي، وبهدف الإستفادة من هؤلاء الباحثين بشكل منظَّم بعد أنْ أسهم الوقف في إعدادهم العلمي والمعرفي؛ قرَّر الوقف تأسيس مركز البحوث الإسلامية الذي أصبح معروفًا باسم (ISAM) ، والذي بدأ أعماله في مبنى الإدارة العامَّة للموسوعة الإسلامية عام 1988 م، وفي عام 1993 م تمَّ دمج هاتين الإدارتين تحت مؤسسة واحدة سُمِّيت: مركز البحوث الإسلامية، وكلمة إيسام (ISAM) مختصرة من بداية كلِّ كلمة من الكلمات الثلاثة: (ISLAM ARA?TIRMALARI MERKEZ?) ،
في المركز مكتبة مُكوَّنة من ثلاثة طوابق، تضمُّ آلاف الكتب والمخطوطات، بالإضافة الى العديد من الوثائق والدفاتر العثمانية التي يفوق عددها 20 ألفًا، كما توجد نسخ إلكترونية مخزنة في موقع المركز على الانترنت لكلِّ محتويات المكتبة، يستطيع الجميع الوصول اليها بكل سهولة حتى دون الحضور الى المكتبة؛ وذلك عن طريق شبكة الانترنت وتعبئة طلب الحصول على نسخة منها، أو طلب كتاب غير موجود بأي لغة، فيقوم المركز بتأمينه للباحث على نفقته الخاصة.
(2) هو مركز أهلي خاص يتبع للدكتور إحسان شن أوجاق، تمَّ تأسيسه نهاية عام 2007 م، وله خمسة فروع في المحافظات التركية: (محافظة سمسمون وفيها المقر الرئيس، محافظة أنقرة، محافظة قونيا، محافظة سقاريا، محافظة سرت) ، ويُعنى المركز بالدراسات الإسلامية والردِّ على الفِرق الضالة، وخاصة بعض الشخصيات التي تتبع منهج المستشرقين والمدرسة العقلية خاصة في تركيا مثل مصطفى إسلام أوغلو ومصطفى أوزترك وغيرهم، الذين يتطاولون على السنة النبوية والإسلام، كما يقوم المركز بنشر الدراسات الإسلامية، فقد نشر خمسة كتب للدكتور إحسان أوجاق بالرد على المتطاولين على الإسلام في تركيا، واحد منها باللغة العربية صدر عن دار إرشاد في إسطنبول، كما يصدر عن المركز مجلة دورية باسم (حكم) تنشر المقالات الفكرية والعلمية والدفاع عن الإسلام، ويتبع للمركز مدارس خاصة داخلية تستقطب الطلاب للمبيت فيها وتدريسهم علوم الشريعة واللغة العربية والأفكار الإسلامية المعتدلة، حيث يمكن لأي طالب الإلتحاق بالمركز والدراسة فيه لمدة خمس سنوات بشكل مجاني، إما بالدراسة الصباحية او المسائية، بمعدَّل خمس ساعات يوميًا، إما في الفترة الصباحية أو المسائية، وذلك توازيًا مع دراسة الطالب في أي تخصص يرغبه في الجامعات الرسمية، فهذا المركز يدرس علوم الشريعة واللغة العربية فقط، ويقدم للطلاب الطعام والمبيت مجانًا، موقع المركز على الانترنت: http://ifam.org.tr /