تميزت العلاقات الثنائية بين افغانستان والباكستان بالعداء والتوتر منذ نشوء جمهورية باكستان سنة 1947، اذ كانت هناك مشكلة حدودية قديمة بينهما، عندما قام الاستعمار البريطاني سنة 1893 باقتطاع اجزاء من الأراضي البشتونية الافغانية وضمها إلى باكستان برسم خط حدودي عرف بخط (دوراند) ، الذي سلخ اقليم بلوشستان من افغانستان، مما أدى إلى نشوب نزاع مسلح سنة 1950 على طول الحدود بين البلدين، وزاد من توتر العلاقات ايضا دخول باكستان في ميثاق بغداد سنة 1955 وحلف جنوب شرق اسيا في السنة نفسها. (1)
ومما عقد المشكلات اکثر اقرار حلف جنوب شرق اسيا سنة 1956 بخط (دوراند) الذي رسمة البريطانيون، فادت هذه الخلافات والمشاكل بين البلدين إلى قطع علاقاتهما الدبلوماسية سنة 1961. وبعد تولي محمد داود خان الحكم الجمهورية في افغانستان سنة 1973 آثار مشكلة (بشتونستان) في قمة عدم الانحياز في الجزائر وفي الامم المتحدة ومؤتمر الدول الاسلامية في لاهور سنة 1974، ولم يتم التوصل إلى نتيجة تذكر حتى سنة 1976، اذ توصل الجانبان إلى توقيع اتفاقية بشان تسوية المشكلة في آذار 1978، الا أن سقوط نظام حکم