أخطر أهل البلدة بتلقيه أوامر بإحراق الأحياء التي شاركت في التمرد، غير أنه قال إنه لن يقدم على تنفيذ أوامره إذا ما سدد الأهالي غرامة مقدارها أربعة آلاف قطعة فضية من العملة العثمانية، وافق الأهالي على سداد الغرامة واتبعوا التعليمات. (28) كما أكد دوجا"للأهالى ما ورد من تعليمات لبونابرت تقضي بأن يرفعوا العلم الفرنسي على مآذن المساجد في المنصورة و أنحاء الدلتا كافة، وأن تحرق البلدات والقرى التي تمتنع عن تنفيذ الأمر. كما أكد مسئول الطباعة أ. جالان A"

وعلى الرغم من انتصار الجنود الفرنسيين في ميدان القتال، فقد واجهوا تحديات كبيرة تمثلت في تدهور حالتهم الصحية في منطقة الدلتا المزدحة

التي تنتشر بها المستنقعات، ويسجل تميليه"الذي بعث إلى المنصورة لفترة قصيرة بعد أن استعادها الفرنسيون: تشهدت هناك مرضا فظيعا يصيب العين وينتشر بين الجلود جميعهم، وقد نتج عنه أن فقد عدد كبير منهم البصر في إحدى العينين أو كلتيهما. (30) وبعد التراكوما"ويطلق عليها الفرنسيون اسم اوفتالميا opthalmnia مرضنا نسيبه البكتيريا ينتشر في وادي النيل. ويسبب المرض ندبات على الجفون فتنمو الأهداب إلى الداخل وتتحول إلى أسلحة قاطعة تؤذي قرنية العين؛ مما يؤدي في بعض الأحيان إلى تدميرها.