وكان ترتيبه للأبواب حسب التراكيب والأساليب اللغوية كالآتي:
الباب الأول: جعله على فصلين:
الأول: في الأحاديث التي ابتدأت ب (من) الموصولة أو الشرطية.
الثاني: في الأحاديث اللتي ابتدأت ب (من) الاستفهامية.
الباب الثاني: في (أن)
الباب الثالث: في (لا)
الباب الرابع: في (إذ) و (إذا)
الباب الخامس: في فصلين:
الاول: في (ما) وأنواعها.
الثاني: في (يا) وأقسامها.
الباب السادس: في اثني عشر فصلا في بعض الكلمات (قد- لقد- بين- هكذا)
الباب السابع: فيه سبعة عشر فصلا مثل (المبتدأ , والمعرف)
الباب الثامن: في ستة فصول
الباب التاسع: في العدد
الباب العاشر: في الفعل الماضي
الباب الحادي عشر: في (لام الابتداء)
الباب الثاني عشر: في الكلمات القدسية [1]
ولأهمية كتاب (مشارق الأنوار من صحاح الأخبار المصطفوية) فقد تولى شرحه عدد كبير من العلماء, اضافة إلى وضع كثير من الحواشي عليه ومن ذلك:-
1 -تحفة الأبرار في شرح مشارق الأنوار: للشيخ أكمل الدين محمد بن محمود البابرتي الحنفي (ت786هـ)
2 -شوارق الأسرار العلية في شرح مشارق الأنوار النبوية: لمجد الدين أبي طاهر محمد بن يعقوب الفيروز آبادي الشيرازي (ت817هـ) .
3 -كشف المشارق: لخير الدين خضر ببن عمر العطوفي (ت948هـ) .
4 -المطالع المصطفوية: للشيخ الامام سعيد بن محمد بن مسعود الكازروني (ت 758هـ) .
5 -حدائق الأزهار في شرح مشارق الأنوار: لوجيه الدين عمر بن عبد المحسن الأرزنجاني، فرغ منه سنة (871هـ)
(1) ينظر: الرسالة المستطرفة لبيان مشهور كتب السنة المصنفة /تاليف محمد بن جعفر الكتاني المتوفى (1335) هجرية (1/ 174) وما بعدها
طبغة دار البشائر الاسلامية بيروت /الطبعة الرابعة/ (1406) هجرية.