وحكم على المارقين الذين رفضوا تغيير معتقداتهم بالموت حرقًا وفي القرن السادس عشر الميلادي حول قادة الكاثوليك نشاط محاكم التفتيش لأنصار المذهب البروتستانتي.
يدين أتباع الكاثوليكية حاليًا محاكم التفتيش؛ لأنها انتهكت قواعد العدالة الحديثة، ولكن لم ينتقد إلا عدد قليل من الناس أساليب محاكم التفتيش أثناء فترة القرون الوسطى.
وصارت مهمة محاكم التفتيش في الأندلس خاصة الكشف عن الإنسان المسلم، وكان الحرق والقتل والسجن والطرد وسيلة تلك المحاكم وقانونها، وكان يكفي لإدانة أي إنسان إذا شهد عليه واش واحد فقط، وقد بلغت حصيلة القتلى في تلك المحاكم ما يقارب الثلاثة ملايين نسمة، وقد استمر تعقب المسلمين في الأندلس عشرات السنين بعد سقوط غرناطة، حتى قضي على المسلمين تمامًا [1] .
(1) انظر الموسوعة العربية العالية (22/ 318) .