ــ كتاب اختصار الحاوي للرازي ؛

ــ كتاب التجربتين على أدوية بن وافد.

وإضافةً إلى هذه المصنفات العلمية، فقد كتب ابن باجة عددًا من الشروحات والمؤلفات الفلسفية، ومن أشهرها:

ــ"رسالة الوداع"؛

ــ"رسالة تدبير المتوحد"؛

توجد مؤلفات ابن باجة في عدد من المكتبات العالمية مثل أكسفورد، والأسكريال، وبرلين.