وفي عام 1989م التقى مانديلا بصورة غير رسمية بالسيد بوتا رئيس وزراء جنوب إفريقيا، ثم بالرئيس الذي تلاه دي كليرك.
أُطلق سراح نيلسون مانديلا في 11 فبراير عام 1990م وانتخب في الشهر التالي نائبًا لرئيس المؤتمر الوطني الإفريقي، واعترفت الحكومة بحزب المؤتمر رسميًا. وفي أوائل عام 1990م قاد مانديلا مجموعة من المفاوضين في محادثات رسمية مع دي كليرك ومسؤولين آخرين في الحكومة. وقد هدفت المفاوضات إلى وضع دستور خاص بجنوب إفريقيا يمنح السود الذين يمثلون أغلبية السكان حق المواطنة والانتخاب.
زار مانديلا عدة دول مثل: كندا، وبريطانيا، والولايات المتحدة لحشد التأييد الدولي للمؤتمر الوطني. وفي أغسطس عام 1990م، أصدر مانديلا أمرًا بإيقاف الكفاح المسلح ضد الحكومة الذي ظل مستمرًا منذ عام 1960م. وانتخب مانديلا رئيسًا للمؤتمر الوطني الإفريقي عام 1991م.
وفي العاشر من مايو عام 1994م أجريت أول انتخابات حرة يشترك فيها البيض والسود فاز فيها مانديلا ليصبح أول رئيس أسود لجنوب إفريقيا بصورة رسمية، وانتهت ثلاثة قرون أو أكثر من التمييز العنصري في تلك البلاد. وفي عام 1997م، أفسح مانديلا المجال لنائبه ثابو مبيكي لتولي رئاسة حزب المؤتمر الوطني الإفريقي، ومن ثم تولى مبيكي رئاسة البلاد عام 1999م.
أعلن مانديلا عام 1992م أنه اتفق وزوجته ويني على الانفصال، وقد تم الطلاق بين الزوجين عام 1996م. وفي عام 1998م، عقد مانديلا قرانه على جراسا ماتشل أرملة سومورا ماتشل رئيس موزمبيق الأسبق.
انظر أيضًا: جنوب إفريقيا؛ الفصل الاجتماعي؛ جوهانسبرج؛ التفرقة العنصرية في جنوب إفريقيا.